Sezon 4.
Syndykat likwiduje informatora Muldera. Tuż przed śmiercią mężczyzna kieruje go do Marity Covarrubias - sekretarz generalnej ONZ. Kobieta zostaje nową "wtyczką", jednak jak się potem okazuje, jest podwójnym szpiegiem, będącym w rzeczywistości na usługach szefa Syndykatu.
Scully ma zaawansowane stadium raka. Skinner negocjuje z Palaczem, żeby ocalić jej życie. Z pomocą zgłasza się także Kritschgau - pracownik Departamentu Obrony. Wmawia on agentom, że są ofiarami manipulacji i wszystko, czego do tej pory się dowiedzieli to kłamstwa.
Krycek i Mulder jadą do Tunguski, gdzie wydobywa się fragmenty meteorytów i przeprowadza eksperymenty z Czarnym Rakiem. Agenci zostają schwytani, ale udaje im się uciec.
Fox wraca do Ameryki, żeby wyjaśnić tę sprawę. Krycek jednak wyeliminował świadków i zniszczył dowody. Sezon kończy się pozorowanym samobójstwem Muldera.
