Rozpad małżeństwa po 11 latach
W czasach świetności swojej kariery aktorka często wdawała się w romanse np. z Markiem Wahlbergiem, Jasonem Priestleyem czy muzykiem Vincem Neilem. W 1993 r. wyszła za mąż za aktora Ashle'a Hamiltona, którego znała zaledwie kilka tygodni. Małżeństwo rozpadło się kilka miesięcy później. Po raz drugi powiedziała "tak" w 2002 r. zawodowemu pokerzyście Rickowi Salomonowi, ale znów rok później nie byli już razem.
Dopiero trzeci mąż Shannen Doherty wydawał się tym jedynym. Z fotografem Kurtem Iswarienko aktorka była związana przez 14 lat (11 w małżeństwie). Przetrwali trudne chwile, gdy aktorka zachorowała na raka. Koniec nastąpił w 2022 r., gdy gwiazda znów walczyła z chorobą i dowiedziała się o zdradzie męża.
- Poszłam na operację wcześnie rano tuż po tym, jak dowiedziałam się, że moje małżeństwo w zasadzie się skończyło, bo mój mąż miał romans przez dwa lata. Chciałam wtedy nie iść na tę operację, chociaż było dla mnie jasne, że on chciał mi towarzyszyć, ale nie mogłam iść tam z nim. Poczułam się taka zdradzona - wyznała w podcaście Let's Be Clear with Shannen Doherty.