Anulowane małżeństwo
Jovovich długo nie mogła ułożyć sobie życia osobistego. Najpierw poślubiła Shawna Andrewsa, którego poznała na planie „Uczniowskiej balangi”. Ponieważ jednak aktorka miała wtedy zaledwie 16 lat, jej małżeństwo anulowano już po dwóch miesiącach.
Potem umawiała się z muzykiem Stuartem Zenderem i fotografem Mario Sorrentim. Jej drugim mężem został Luc Besson, z którym pracowała przy „Piątym elemencie”, ale para rozwiodła się już po dwóch latach.
W połowie 2009 roku poślubiła reżysera Paula W. S. Andersona, którego poznała podczas kręcenia filmu „Resident Evil”. Anderson oświadczył się pięknej aktorce już rok po premierze, w 2003 roku, jednak zanim doszło do legalizacji związku, para się rozstała... Tylko po to, by wkrótce zejść się ponownie.