Długo poszukiwała prawdziwej miłości
Boyle znana jest ze swojej słabości do mężczyzn. Gwiazda "Miasteczka Twin Peaks" długo szukała idealnego partnera. Lara często wiązała się z aktorami, z którymi pracowała na planach kolejnych filmów. Głośno mówiło się o relacjach łączących ją z Richardem Deanem Andersonem czy Kylem MacLachlanem.
Prawdziwą sensację wywołał jednak jej związek z dużo starszym od niej gwiazdorem amerykańskiego kina, Jackiem Nicholsonem. Ich romans wyszedł na jaw w 1999 roku. Para aktorów spowodowała wypadek samochodowy. Nikomu nic się nie stało, jednak ich wspólne zdjęcia trafiły na strony większości plotkarskich gazet.
Co wzbudziło tak wielkie zainteresowanie mediów? Okazało się, że Lara gra na dwa fronty. Kobieta umawiała się z Nicholsonem, jednocześnie będąc związaną z innym aktorem, Davidem Spade`em.
Flynn Boyle dwukrotnie wychodziła za mąż. Od 2006 roku jest żoną Donalda Raya Thomasa, biznesmena inwestującego w nieruchomości.